El objetivo del congreso es fomentar el encuentro y la colaboración entre los Jóvenes Investigadores que desarrollan sus trabajos de investigación en el ámbito marino. Los objetivos marcados por el I Congreso Iberoamericano Jóvenes Investigadores del mar se centran en:

• Promover la interdisciplinariedad entre los jóvenes investigadores que llevan a cabo su actividad en diferentes centros de investigación tanto públicos como del sector privado.
• Establecer vías de cooperación entre los jóvenes investigadores potenciando sinergias en investigación marina.
• Fomentar y dinamizar la presentación de trabajos científicos realizados por las nuevas generaciones de investigadores en el ámbito del mar.
• Difundir y promover el objetivo 14 de los ODS: Conservar y utilizar sosteniblemente los océanos, los mares y los recursos marinos para el desarrollo sostenible.

Se pretende crear un punto de conexión entre los distintos grupos de investigación dentro del ámbito marino, donde sean los propios jóvenes investigadores los que expongan sus áreas de trabajo, así como sus inquietudes y dificultades en esta etapa. Con este encuentro se pretende mejorar la difusión de la información entre las distintas líneas de investigación, fomentando futuras colaboraciones y proyectos con un alto valor multidisciplinar.